Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms