Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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