Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms