Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms