Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms