Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms