Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms