Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms