Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hoxb5P09079 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb5P09079 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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