Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms