Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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