Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms