Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms