Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PdgfrbP05622 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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