Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms