Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamc1P02468 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms