Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HbaP01942 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HbaP01942 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HbaP01942 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HbaP01942 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HbaP01942 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HbaP01942 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HbaP01942 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HbaP01942 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HbaP01942 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HbaP01942 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HbaP01942 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HbaP01942 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HbaP01942 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HbaP01942 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HbaP01942 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HbaP01942 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HbaP01942 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HbaP01942 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HbaP01942 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms