Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01654 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01654 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01654 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01654 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01654 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01654 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01654 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01654 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01654 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01654 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01654 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01654 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01654 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01654 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms