Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01649 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01649 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01649 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P01649 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P01649 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P01649 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P01649 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P01649 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P01649 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P01649 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms