Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01648 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01648 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01648 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01648 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01648 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01648 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01648 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01648 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms