Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp1O89090 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp1O89090 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp1O89090 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms