Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda1O88958 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms