Protein–RNA interactions for Protein: O88907

Pias1, E3 SUMO-protein ligase PIAS1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias1O88907 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pias1O88907 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pias1O88907 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pias1O88907 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pias1O88907 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pias1O88907 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms