Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BlmO88700 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BlmO88700 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BlmO88700 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BlmO88700 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BlmO88700 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BlmO88700 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BlmO88700 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BlmO88700 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BlmO88700 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BlmO88700 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BlmO88700 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BlmO88700 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BlmO88700 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BlmO88700 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BlmO88700 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BlmO88700 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BlmO88700 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BlmO88700 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BlmO88700 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BlmO88700 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BlmO88700 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BlmO88700 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BlmO88700 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BlmO88700 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BlmO88700 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms