Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3bO88509 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms