Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capns1O88456 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Capns1O88456 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms