Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid1O70583 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid1O70583 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid1O70583 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms