Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SfnO70456 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SfnO70456 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SfnO70456 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SfnO70456 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SfnO70456 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SfnO70456 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SfnO70456 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SfnO70456 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SfnO70456 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SfnO70456 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SfnO70456 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SfnO70456 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SfnO70456 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SfnO70456 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SfnO70456 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SfnO70456 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SfnO70456 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SfnO70456 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SfnO70456 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SfnO70456 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SfnO70456 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SfnO70456 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SfnO70456 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms