Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma3O70435 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma3O70435 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma3O70435 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma3O70435 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psma3O70435 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Psma3O70435 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms