Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms