Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms