Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2a2O55143 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms