Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl35aO55142 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms