Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngr2O55101 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms