Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1bO55017 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms