Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl25O35903 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ccl25O35903 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ccl25O35903 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ccl25O35903 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ccl25O35903 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccl25O35903 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl25O35903 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms