Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms