Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms