Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms