Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Prrt1O35449 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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