Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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