Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2O35245 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms