Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms