Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Casq1O09165 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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