Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq2O09161 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq2O09161 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq2O09161 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq2O09161 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq2O09161 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq2O09161 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq2O09161 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq2O09161 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq2O09161 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq2O09161 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq2O09161 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Casq2O09161 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq2O09161 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Casq2O09161 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Casq2O09161 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Casq2O09161 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Casq2O09161 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casq2O09161 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Casq2O09161 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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