Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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