Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms