Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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