Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efna5O08543 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna5O08543 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms