Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MsmbO08540 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MsmbO08540 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MsmbO08540 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MsmbO08540 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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